提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
内地居民赴港澳旅游将恢复 春节或迎出游小高峰******
中新网广州1月5日电 (记者 程景伟)国务院联防联控机制综合组5日发布《关于优化内地与港澳人员往来措施的通知》(以下称《通知》),决定优化内地与港澳人员往来措施,自2023年1月8日起实施。《通知》公布,根据香港、澳门疫情形势和各方面服务保障能力,有序恢复内地居民赴香港、澳门旅游。
该消息发布后,内地在线旅游平台“同程旅行”的香港旅游产品、内地往返香港的机票、香港酒店搜索量大幅上涨。同程研究院相关专家分析,香港、澳门一直是内地居民的热门旅行目的地。从目前当地的机票和酒店搜索情况看,春节假期赴港旅游客流将迎来一波小高峰。
携程研究院战略研究中心高级研究员沈佳旎称,内地游客已与香港暌违三年之久,目前两地恢复通关在即,叠加春节出行预订窗口期,预计香港旅游业将于春节前夕迎来一波显著的复苏势头。香港极具特色的购物、美食、展览等亮点,将让香港继续成为内地以及海外旅客乐于选择的热门目的地。
内地游客赴香港的热情也正在燃起。据介绍,携程平台上,自12月27日至今,内地赴香港的机票预订量环比增长36%,其中上海、北京、杭州用户赴香港的机票预订较多。值得一提的是,预订今年春节假期内地至香港的机票订单量同比增长18倍。
记者从广州大型旅行社“广之旅”方面了解到,香港旅游产品正逐步恢复上架,相关产品为自由行产品。据介绍,广之旅正在恢复上架的香港游产品,包括香港酒店、主题乐园等景区门票的单项代订,“香港酒店+景区门票套票”自由行产品,比如迪士尼探索家度假酒店套票、“九龙富豪酒店、香港荃湾丝丽酒店+迪士尼乐园”3天2晚套票;“历山酒店、华丽铜锣湾酒店+海洋公园”3天2晚套票等。该社正密切与香港各旅游接待资源方对接,持续丰富相关产品。(完)